Хорошие манеры у Шерлока хранятся где-то в Minde palace, в чулане под лестницей. Он их достает когда ему это нужно. Причем судя по речевым оборотам учил его всё-таки Майкрофт. В тех же случаях когда Шерлоку нужно экспромтом сказать "спасибо" или "извини" он начинает бормотать, заикаться или вообще нести всякую чушь ("Ты.. э-э-э то, что ты там сделал, э-э-э намеревался сделать...Это было... хорошо).
В сцене с просьбой Джона стать его шафером, Шерлок по-видимому как раз отлучился за подходящими словами к себе в голову ("Когда Джон впервые поднял вопрос о шафере, я был смущён. Я признаюсь, что сперва не совсем уловил суть, а уловив, был весьма польщён и удивлён. Я объяснил, что поскольку просьба была внезапной, она меня немного обескуражила. Как бы то ни было, я пообещал ему предпринять всё, что от меня зависит, чтобы выполнить труднейшее задание в моей практике. В заключение я его поблагодарил за доверие, оказанное мне, и засвидетельствовал, что я, в некотором роде, почти взволнован этим"). Но по пути не удержался и заглянул еще раз перепроверить факты: если свой статус друга он как-то еще соотнес со сложившейся картиной мира, то "лучший друг" эту самую картину напрочь ломает. Поэтому он перепроверяет факты и не найдя ничего нового еще раз уточняет ("Y-you mean..." "Yes." "I’m your..best.." "Man." "Friend?").